مرجع رسیدگی در ماده ۲۵۱ شورایعالی مالیاتی است. شورایعالی مالیاتی اگر اعتراض مودی را بپذیرد، رای صادر میکند که به شعبه همعرض ارجاع شود و اگر نپذیرد، شکایت رد میگردد.
ولی در ۲۵۱مکرر مستقیم رای صادر میگردد. ماده۲۵۱، اعتراض مودی یا دادستان انتظامی مالیاتی به رای هیئت تجدید نظر میباشد که مهلت ۲ ماههای جهت اعتراض و طرح در شورایعالی مالیاتی وجود دارد. اگر این مهلت سپری گردد، امکان اعتراض وجود ندارد. هم مودی و هم دادستان انتظامی مالیاتی یا هرکدام به تنهایی میتوانند اعتراض خود را ثبت نمایند.
در ۲۵۱، میبایست پرونده الزاما به هیات بدوی و سپس به هیئت تجدیدنظر رفته و رای صادر شده باشد. اگر شکایت در شورایعالی مالیاتی پذیرفته نشود،رد شکایت میزنن و پرونده مختومه میگردد و اگر شکایت پذیرفته شود، پرونده به هیات همعرض ماده ۲۵۷ ارجاع شده و رای صادر میگردد.
اما در ۲۵۱مکرر مهلت اعتراض محدود ندارد. هر زمان مودی به ناعادلانه بودن مالیات معترض باشد، میتواند به برگ قطعی شکایت کند. پرونده نباید در هیچ هیات دیگری قابل طرح باشد. برگ قطعی میتواند ناشی از سکوت، تمکین و رای بدوی و رای تجدیدنظر، رای ۲۱۶، و یا رای همعرض باشد.